En çok kullanılan jel elektroforezi yöntemleri 
agaroz jel elektroforezi  ve poliakrilamid jel elektroforezi dir.  genellikle 
agaroz jel,
Kaynak: Jel elektroforeziNükleik asitler genelde bir 
agaroz jeli içinde elektroforezle ayrıştırılır, jel bir EtBr çözeltisi içinde bir süre bekletilince EtBr
Kaynak: Etidyum bromürDNA ayrıca streptavidin kaplı 
agaroz mikrokürelere, polistiren  ve hatta paramanyetik boncuklara de bağlanabilir.  Bu kompleksler en yaygın
Kaynak: Streptavidin